Protein–RNA interactions for Protein: Q9H841

NIPAL2, NIPA-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL2Q9H841 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPAL2Q9H841 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPAL2Q9H841 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NIPAL2Q9H841 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPAL2Q9H841 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms