Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RPAP3Q9H6T3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RPAP3Q9H6T3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RPAP3Q9H6T3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RPAP3Q9H6T3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RPAP3Q9H6T3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RPAP3Q9H6T3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RPAP3Q9H6T3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RPAP3Q9H6T3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RPAP3Q9H6T3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RPAP3Q9H6T3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RPAP3Q9H6T3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RPAP3Q9H6T3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RPAP3Q9H6T3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RPAP3Q9H6T3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RPAP3Q9H6T3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RPAP3Q9H6T3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RPAP3Q9H6T3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RPAP3Q9H6T3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RPAP3Q9H6T3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RPAP3Q9H6T3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RPAP3Q9H6T3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RPAP3Q9H6T3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RPAP3Q9H6T3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RPAP3Q9H6T3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RPAP3Q9H6T3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RPAP3Q9H6T3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RPAP3Q9H6T3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RPAP3Q9H6T3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RPAP3Q9H6T3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RPAP3Q9H6T3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RPAP3Q9H6T3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RPAP3Q9H6T3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RPAP3Q9H6T3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RPAP3Q9H6T3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RPAP3Q9H6T3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RPAP3Q9H6T3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RPAP3Q9H6T3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RPAP3Q9H6T3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
RPAP3Q9H6T3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
RPAP3Q9H6T3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RPAP3Q9H6T3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
RPAP3Q9H6T3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RPAP3Q9H6T3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RPAP3Q9H6T3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RPAP3Q9H6T3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RPAP3Q9H6T3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RPAP3Q9H6T3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
RPAP3Q9H6T3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPAP3Q9H6T3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPAP3Q9H6T3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
RPAP3Q9H6T3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPAP3Q9H6T3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPAP3Q9H6T3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPAP3Q9H6T3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPAP3Q9H6T3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPAP3Q9H6T3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPAP3Q9H6T3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPAP3Q9H6T3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
RPAP3Q9H6T3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPAP3Q9H6T3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPAP3Q9H6T3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPAP3Q9H6T3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPAP3Q9H6T3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPAP3Q9H6T3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPAP3Q9H6T3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPAP3Q9H6T3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPAP3Q9H6T3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPAP3Q9H6T3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPAP3Q9H6T3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPAP3Q9H6T3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPAP3Q9H6T3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
RPAP3Q9H6T3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPAP3Q9H6T3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPAP3Q9H6T3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPAP3Q9H6T3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPAP3Q9H6T3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPAP3Q9H6T3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms