Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRABDQ9H4I3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRABDQ9H4I3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRABDQ9H4I3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRABDQ9H4I3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRABDQ9H4I3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRABDQ9H4I3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRABDQ9H4I3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRABDQ9H4I3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRABDQ9H4I3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRABDQ9H4I3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRABDQ9H4I3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRABDQ9H4I3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRABDQ9H4I3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRABDQ9H4I3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRABDQ9H4I3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRABDQ9H4I3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRABDQ9H4I3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRABDQ9H4I3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRABDQ9H4I3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRABDQ9H4I3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRABDQ9H4I3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRABDQ9H4I3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRABDQ9H4I3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRABDQ9H4I3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRABDQ9H4I3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRABDQ9H4I3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRABDQ9H4I3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRABDQ9H4I3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRABDQ9H4I3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRABDQ9H4I3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRABDQ9H4I3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRABDQ9H4I3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRABDQ9H4I3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRABDQ9H4I3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRABDQ9H4I3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRABDQ9H4I3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRABDQ9H4I3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRABDQ9H4I3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRABDQ9H4I3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRABDQ9H4I3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRABDQ9H4I3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRABDQ9H4I3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRABDQ9H4I3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRABDQ9H4I3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRABDQ9H4I3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRABDQ9H4I3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRABDQ9H4I3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRABDQ9H4I3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRABDQ9H4I3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRABDQ9H4I3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRABDQ9H4I3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRABDQ9H4I3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRABDQ9H4I3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRABDQ9H4I3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRABDQ9H4I3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRABDQ9H4I3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRABDQ9H4I3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRABDQ9H4I3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRABDQ9H4I3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRABDQ9H4I3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRABDQ9H4I3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRABDQ9H4I3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRABDQ9H4I3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRABDQ9H4I3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRABDQ9H4I3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRABDQ9H4I3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRABDQ9H4I3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRABDQ9H4I3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRABDQ9H4I3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRABDQ9H4I3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRABDQ9H4I3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRABDQ9H4I3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRABDQ9H4I3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRABDQ9H4I3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRABDQ9H4I3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRABDQ9H4I3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms