Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIPK3Q9H422 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIPK3Q9H422 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIPK3Q9H422 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIPK3Q9H422 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIPK3Q9H422 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIPK3Q9H422 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIPK3Q9H422 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIPK3Q9H422 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIPK3Q9H422 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIPK3Q9H422 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIPK3Q9H422 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIPK3Q9H422 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
HIPK3Q9H422 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HIPK3Q9H422 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HIPK3Q9H422 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIPK3Q9H422 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIPK3Q9H422 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIPK3Q9H422 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIPK3Q9H422 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIPK3Q9H422 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HIPK3Q9H422 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HIPK3Q9H422 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HIPK3Q9H422 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIPK3Q9H422 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIPK3Q9H422 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIPK3Q9H422 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HIPK3Q9H422 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIPK3Q9H422 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIPK3Q9H422 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIPK3Q9H422 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIPK3Q9H422 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIPK3Q9H422 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIPK3Q9H422 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HIPK3Q9H422 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HIPK3Q9H422 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HIPK3Q9H422 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HIPK3Q9H422 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HIPK3Q9H422 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HIPK3Q9H422 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIPK3Q9H422 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HIPK3Q9H422 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HIPK3Q9H422 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HIPK3Q9H422 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIPK3Q9H422 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIPK3Q9H422 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIPK3Q9H422 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIPK3Q9H422 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIPK3Q9H422 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIPK3Q9H422 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HIPK3Q9H422 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HIPK3Q9H422 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HIPK3Q9H422 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HIPK3Q9H422 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HIPK3Q9H422 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HIPK3Q9H422 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HIPK3Q9H422 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HIPK3Q9H422 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HIPK3Q9H422 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HIPK3Q9H422 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIPK3Q9H422 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIPK3Q9H422 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIPK3Q9H422 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIPK3Q9H422 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIPK3Q9H422 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIPK3Q9H422 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIPK3Q9H422 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIPK3Q9H422 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIPK3Q9H422 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIPK3Q9H422 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIPK3Q9H422 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIPK3Q9H422 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIPK3Q9H422 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIPK3Q9H422 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIPK3Q9H422 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIPK3Q9H422 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIPK3Q9H422 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIPK3Q9H422 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms