Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U2

PPA2, Inorganic pyrophosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPA2Q9H2U2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPA2Q9H2U2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPA2Q9H2U2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPA2Q9H2U2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPA2Q9H2U2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPA2Q9H2U2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPA2Q9H2U2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPA2Q9H2U2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PPA2Q9H2U2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPA2Q9H2U2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPA2Q9H2U2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPA2Q9H2U2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPA2Q9H2U2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPA2Q9H2U2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPA2Q9H2U2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPA2Q9H2U2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPA2Q9H2U2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPA2Q9H2U2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPA2Q9H2U2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPA2Q9H2U2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPA2Q9H2U2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPA2Q9H2U2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPA2Q9H2U2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPA2Q9H2U2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms