Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH19Q9H159 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH19Q9H159 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH19Q9H159 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH19Q9H159 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH19Q9H159 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH19Q9H159 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH19Q9H159 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH19Q9H159 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH19Q9H159 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH19Q9H159 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH19Q9H159 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH19Q9H159 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH19Q9H159 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH19Q9H159 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH19Q9H159 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH19Q9H159 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH19Q9H159 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH19Q9H159 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH19Q9H159 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH19Q9H159 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH19Q9H159 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH19Q9H159 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH19Q9H159 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH19Q9H159 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH19Q9H159 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH19Q9H159 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH19Q9H159 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH19Q9H159 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH19Q9H159 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH19Q9H159 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH19Q9H159 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH19Q9H159 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH19Q9H159 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH19Q9H159 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH19Q9H159 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH19Q9H159 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH19Q9H159 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH19Q9H159 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH19Q9H159 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDH19Q9H159 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH19Q9H159 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH19Q9H159 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH19Q9H159 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH19Q9H159 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH19Q9H159 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH19Q9H159 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH19Q9H159 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH19Q9H159 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH19Q9H159 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH19Q9H159 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH19Q9H159 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDH19Q9H159 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDH19Q9H159 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH19Q9H159 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms