Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W9

C11orf54, Ester hydrolase C11orf54, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf54Q9H0W9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf54Q9H0W9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf54Q9H0W9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf54Q9H0W9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf54Q9H0W9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf54Q9H0W9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf54Q9H0W9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf54Q9H0W9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf54Q9H0W9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C11orf54Q9H0W9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C11orf54Q9H0W9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C11orf54Q9H0W9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf54Q9H0W9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf54Q9H0W9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf54Q9H0W9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf54Q9H0W9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf54Q9H0W9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf54Q9H0W9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf54Q9H0W9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf54Q9H0W9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C11orf54Q9H0W9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf54Q9H0W9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf54Q9H0W9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf54Q9H0W9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf54Q9H0W9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf54Q9H0W9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf54Q9H0W9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf54Q9H0W9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf54Q9H0W9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf54Q9H0W9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C11orf54Q9H0W9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf54Q9H0W9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf54Q9H0W9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf54Q9H0W9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf54Q9H0W9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf54Q9H0W9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf54Q9H0W9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf54Q9H0W9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf54Q9H0W9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf54Q9H0W9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf54Q9H0W9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf54Q9H0W9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf54Q9H0W9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf54Q9H0W9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf54Q9H0W9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf54Q9H0W9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf54Q9H0W9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf54Q9H0W9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf54Q9H0W9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf54Q9H0W9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C11orf54Q9H0W9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf54Q9H0W9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf54Q9H0W9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf54Q9H0W9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf54Q9H0W9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf54Q9H0W9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf54Q9H0W9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf54Q9H0W9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf54Q9H0W9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf54Q9H0W9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf54Q9H0W9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf54Q9H0W9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf54Q9H0W9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf54Q9H0W9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf54Q9H0W9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf54Q9H0W9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf54Q9H0W9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf54Q9H0W9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms