Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ6

CHRNA10, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-10, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA10Q9GZZ6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA10Q9GZZ6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA10Q9GZZ6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA10Q9GZZ6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA10Q9GZZ6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA10Q9GZZ6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA10Q9GZZ6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA10Q9GZZ6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA10Q9GZZ6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA10Q9GZZ6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA10Q9GZZ6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA10Q9GZZ6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA10Q9GZZ6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA10Q9GZZ6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA10Q9GZZ6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA10Q9GZZ6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA10Q9GZZ6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA10Q9GZZ6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA10Q9GZZ6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA10Q9GZZ6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA10Q9GZZ6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA10Q9GZZ6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA10Q9GZZ6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA10Q9GZZ6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA10Q9GZZ6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA10Q9GZZ6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA10Q9GZZ6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA10Q9GZZ6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA10Q9GZZ6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA10Q9GZZ6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA10Q9GZZ6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA10Q9GZZ6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA10Q9GZZ6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA10Q9GZZ6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHRNA10Q9GZZ6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNA10Q9GZZ6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNA10Q9GZZ6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNA10Q9GZZ6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA10Q9GZZ6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA10Q9GZZ6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA10Q9GZZ6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA10Q9GZZ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA10Q9GZZ6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA10Q9GZZ6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA10Q9GZZ6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA10Q9GZZ6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA10Q9GZZ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA10Q9GZZ6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA10Q9GZZ6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA10Q9GZZ6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA10Q9GZZ6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA10Q9GZZ6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA10Q9GZZ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
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