Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR1EQ9GZS1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR1EQ9GZS1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR1EQ9GZS1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR1EQ9GZS1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1EQ9GZS1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1EQ9GZS1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1EQ9GZS1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1EQ9GZS1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR1EQ9GZS1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1EQ9GZS1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1EQ9GZS1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1EQ9GZS1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1EQ9GZS1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1EQ9GZS1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1EQ9GZS1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR1EQ9GZS1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR1EQ9GZS1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1EQ9GZS1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1EQ9GZS1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1EQ9GZS1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1EQ9GZS1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1EQ9GZS1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1EQ9GZS1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1EQ9GZS1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1EQ9GZS1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms