Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BCL11BQ9C0K0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BCL11BQ9C0K0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BCL11BQ9C0K0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
BCL11BQ9C0K0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BCL11BQ9C0K0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BCL11BQ9C0K0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BCL11BQ9C0K0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
BCL11BQ9C0K0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
BCL11BQ9C0K0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BCL11BQ9C0K0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
BCL11BQ9C0K0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
BCL11BQ9C0K0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BCL11BQ9C0K0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BCL11BQ9C0K0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BCL11BQ9C0K0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BCL11BQ9C0K0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
BCL11BQ9C0K0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
BCL11BQ9C0K0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
BCL11BQ9C0K0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
BCL11BQ9C0K0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
BCL11BQ9C0K0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
BCL11BQ9C0K0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BCL11BQ9C0K0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
BCL11BQ9C0K0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
BCL11BQ9C0K0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
BCL11BQ9C0K0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
BCL11BQ9C0K0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
BCL11BQ9C0K0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
BCL11BQ9C0K0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BCL11BQ9C0K0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BCL11BQ9C0K0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
BCL11BQ9C0K0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
BCL11BQ9C0K0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
BCL11BQ9C0K0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
BCL11BQ9C0K0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
BCL11BQ9C0K0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
BCL11BQ9C0K0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BCL11BQ9C0K0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BCL11BQ9C0K0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BCL11BQ9C0K0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
BCL11BQ9C0K0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
BCL11BQ9C0K0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BCL11BQ9C0K0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
BCL11BQ9C0K0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
BCL11BQ9C0K0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BCL11BQ9C0K0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BCL11BQ9C0K0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BCL11BQ9C0K0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BCL11BQ9C0K0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
BCL11BQ9C0K0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
BCL11BQ9C0K0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
BCL11BQ9C0K0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BCL11BQ9C0K0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
BCL11BQ9C0K0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
BCL11BQ9C0K0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
BCL11BQ9C0K0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BCL11BQ9C0K0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
BCL11BQ9C0K0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
BCL11BQ9C0K0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
BCL11BQ9C0K0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
BCL11BQ9C0K0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
BCL11BQ9C0K0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
BCL11BQ9C0K0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
BCL11BQ9C0K0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
BCL11BQ9C0K0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
BCL11BQ9C0K0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
BCL11BQ9C0K0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BCL11BQ9C0K0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
BCL11BQ9C0K0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BCL11BQ9C0K0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
BCL11BQ9C0K0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
BCL11BQ9C0K0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
BCL11BQ9C0K0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
BCL11BQ9C0K0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
BCL11BQ9C0K0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
BCL11BQ9C0K0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms