Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM6Q9C030 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM6Q9C030 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM6Q9C030 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM6Q9C030 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM6Q9C030 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM6Q9C030 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM6Q9C030 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM6Q9C030 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM6Q9C030 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM6Q9C030 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM6Q9C030 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM6Q9C030 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM6Q9C030 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM6Q9C030 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM6Q9C030 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM6Q9C030 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM6Q9C030 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM6Q9C030 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM6Q9C030 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM6Q9C030 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM6Q9C030 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM6Q9C030 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM6Q9C030 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM6Q9C030 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM6Q9C030 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM6Q9C030 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM6Q9C030 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM6Q9C030 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM6Q9C030 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM6Q9C030 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM6Q9C030 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM6Q9C030 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM6Q9C030 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM6Q9C030 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM6Q9C030 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM6Q9C030 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM6Q9C030 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM6Q9C030 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM6Q9C030 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM6Q9C030 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM6Q9C030 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM6Q9C030 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM6Q9C030 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM6Q9C030 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM6Q9C030 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM6Q9C030 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM6Q9C030 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM6Q9C030 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM6Q9C030 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM6Q9C030 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM6Q9C030 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM6Q9C030 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM6Q9C030 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM6Q9C030 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM6Q9C030 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM6Q9C030 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM6Q9C030 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM6Q9C030 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM6Q9C030 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM6Q9C030 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM6Q9C030 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM6Q9C030 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM6Q9C030 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM6Q9C030 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM6Q9C030 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM6Q9C030 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms