Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG5

PARD6B, Partitioning defective 6 homolog beta, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6BQ9BYG5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARD6BQ9BYG5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARD6BQ9BYG5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARD6BQ9BYG5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARD6BQ9BYG5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARD6BQ9BYG5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARD6BQ9BYG5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARD6BQ9BYG5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARD6BQ9BYG5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PARD6BQ9BYG5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PARD6BQ9BYG5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARD6BQ9BYG5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARD6BQ9BYG5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARD6BQ9BYG5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARD6BQ9BYG5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARD6BQ9BYG5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARD6BQ9BYG5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARD6BQ9BYG5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARD6BQ9BYG5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARD6BQ9BYG5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARD6BQ9BYG5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARD6BQ9BYG5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARD6BQ9BYG5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARD6BQ9BYG5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARD6BQ9BYG5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARD6BQ9BYG5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARD6BQ9BYG5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARD6BQ9BYG5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARD6BQ9BYG5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARD6BQ9BYG5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARD6BQ9BYG5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARD6BQ9BYG5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PARD6BQ9BYG5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARD6BQ9BYG5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARD6BQ9BYG5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARD6BQ9BYG5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARD6BQ9BYG5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARD6BQ9BYG5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARD6BQ9BYG5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARD6BQ9BYG5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARD6BQ9BYG5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARD6BQ9BYG5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARD6BQ9BYG5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARD6BQ9BYG5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARD6BQ9BYG5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARD6BQ9BYG5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PARD6BQ9BYG5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PARD6BQ9BYG5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PARD6BQ9BYG5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARD6BQ9BYG5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARD6BQ9BYG5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARD6BQ9BYG5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARD6BQ9BYG5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARD6BQ9BYG5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARD6BQ9BYG5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARD6BQ9BYG5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARD6BQ9BYG5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARD6BQ9BYG5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARD6BQ9BYG5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARD6BQ9BYG5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PARD6BQ9BYG5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARD6BQ9BYG5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARD6BQ9BYG5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARD6BQ9BYG5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARD6BQ9BYG5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARD6BQ9BYG5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARD6BQ9BYG5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARD6BQ9BYG5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARD6BQ9BYG5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARD6BQ9BYG5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARD6BQ9BYG5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PARD6BQ9BYG5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARD6BQ9BYG5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms