Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP8

PAPPA2, Pappalysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA2Q9BXP8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PAPPA2Q9BXP8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PAPPA2Q9BXP8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PAPPA2Q9BXP8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PAPPA2Q9BXP8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PAPPA2Q9BXP8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PAPPA2Q9BXP8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PAPPA2Q9BXP8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PAPPA2Q9BXP8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PAPPA2Q9BXP8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PAPPA2Q9BXP8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PAPPA2Q9BXP8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PAPPA2Q9BXP8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PAPPA2Q9BXP8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PAPPA2Q9BXP8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PAPPA2Q9BXP8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PAPPA2Q9BXP8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PAPPA2Q9BXP8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PAPPA2Q9BXP8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PAPPA2Q9BXP8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PAPPA2Q9BXP8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PAPPA2Q9BXP8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PAPPA2Q9BXP8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PAPPA2Q9BXP8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PAPPA2Q9BXP8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PAPPA2Q9BXP8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PAPPA2Q9BXP8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PAPPA2Q9BXP8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PAPPA2Q9BXP8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PAPPA2Q9BXP8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PAPPA2Q9BXP8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PAPPA2Q9BXP8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PAPPA2Q9BXP8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PAPPA2Q9BXP8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PAPPA2Q9BXP8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PAPPA2Q9BXP8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PAPPA2Q9BXP8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PAPPA2Q9BXP8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PAPPA2Q9BXP8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PAPPA2Q9BXP8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PAPPA2Q9BXP8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PAPPA2Q9BXP8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PAPPA2Q9BXP8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PAPPA2Q9BXP8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PAPPA2Q9BXP8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PAPPA2Q9BXP8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PAPPA2Q9BXP8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PAPPA2Q9BXP8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PAPPA2Q9BXP8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PAPPA2Q9BXP8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PAPPA2Q9BXP8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PAPPA2Q9BXP8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PAPPA2Q9BXP8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PAPPA2Q9BXP8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PAPPA2Q9BXP8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PAPPA2Q9BXP8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PAPPA2Q9BXP8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PAPPA2Q9BXP8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PAPPA2Q9BXP8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PAPPA2Q9BXP8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PAPPA2Q9BXP8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PAPPA2Q9BXP8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PAPPA2Q9BXP8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PAPPA2Q9BXP8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PAPPA2Q9BXP8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PAPPA2Q9BXP8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PAPPA2Q9BXP8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PAPPA2Q9BXP8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PAPPA2Q9BXP8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PAPPA2Q9BXP8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PAPPA2Q9BXP8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PAPPA2Q9BXP8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PAPPA2Q9BXP8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PAPPA2Q9BXP8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PAPPA2Q9BXP8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PAPPA2Q9BXP8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PAPPA2Q9BXP8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PAPPA2Q9BXP8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PAPPA2Q9BXP8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PAPPA2Q9BXP8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PAPPA2Q9BXP8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PAPPA2Q9BXP8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PAPPA2Q9BXP8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PAPPA2Q9BXP8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PAPPA2Q9BXP8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PAPPA2Q9BXP8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PAPPA2Q9BXP8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PAPPA2Q9BXP8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PAPPA2Q9BXP8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PAPPA2Q9BXP8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PAPPA2Q9BXP8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PAPPA2Q9BXP8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PAPPA2Q9BXP8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PAPPA2Q9BXP8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PAPPA2Q9BXP8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PAPPA2Q9BXP8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PAPPA2Q9BXP8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PAPPA2Q9BXP8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PAPPA2Q9BXP8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PAPPA2Q9BXP8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms