Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CARD11Q9BXL7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CARD11Q9BXL7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CARD11Q9BXL7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CARD11Q9BXL7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CARD11Q9BXL7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CARD11Q9BXL7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CARD11Q9BXL7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CARD11Q9BXL7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CARD11Q9BXL7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CARD11Q9BXL7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
CARD11Q9BXL7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CARD11Q9BXL7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CARD11Q9BXL7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CARD11Q9BXL7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CARD11Q9BXL7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CARD11Q9BXL7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CARD11Q9BXL7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CARD11Q9BXL7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CARD11Q9BXL7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CARD11Q9BXL7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
CARD11Q9BXL7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
CARD11Q9BXL7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CARD11Q9BXL7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CARD11Q9BXL7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CARD11Q9BXL7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CARD11Q9BXL7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CARD11Q9BXL7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CARD11Q9BXL7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CARD11Q9BXL7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CARD11Q9BXL7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CARD11Q9BXL7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
CARD11Q9BXL7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
CARD11Q9BXL7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
CARD11Q9BXL7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CARD11Q9BXL7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CARD11Q9BXL7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CARD11Q9BXL7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CARD11Q9BXL7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CARD11Q9BXL7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CARD11Q9BXL7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CARD11Q9BXL7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CARD11Q9BXL7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CARD11Q9BXL7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CARD11Q9BXL7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CARD11Q9BXL7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CARD11Q9BXL7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CARD11Q9BXL7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CARD11Q9BXL7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
CARD11Q9BXL7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CARD11Q9BXL7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CARD11Q9BXL7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CARD11Q9BXL7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CARD11Q9BXL7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CARD11Q9BXL7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
CARD11Q9BXL7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CARD11Q9BXL7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CARD11Q9BXL7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CARD11Q9BXL7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CARD11Q9BXL7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CARD11Q9BXL7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CARD11Q9BXL7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CARD11Q9BXL7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CARD11Q9BXL7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CARD11Q9BXL7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CARD11Q9BXL7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CARD11Q9BXL7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CARD11Q9BXL7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CARD11Q9BXL7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms