Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1QTNF3Q9BXJ4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C1QTNF3Q9BXJ4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1QTNF3Q9BXJ4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1QTNF3Q9BXJ4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1QTNF3Q9BXJ4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1QTNF3Q9BXJ4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1QTNF3Q9BXJ4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1QTNF3Q9BXJ4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1QTNF3Q9BXJ4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1QTNF3Q9BXJ4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1QTNF3Q9BXJ4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1QTNF3Q9BXJ4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
C1QTNF3Q9BXJ4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C1QTNF3Q9BXJ4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1QTNF3Q9BXJ4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1QTNF3Q9BXJ4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1QTNF3Q9BXJ4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1QTNF3Q9BXJ4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1QTNF3Q9BXJ4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1QTNF3Q9BXJ4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1QTNF3Q9BXJ4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1QTNF3Q9BXJ4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1QTNF3Q9BXJ4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1QTNF3Q9BXJ4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1QTNF3Q9BXJ4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1QTNF3Q9BXJ4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1QTNF3Q9BXJ4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1QTNF3Q9BXJ4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1QTNF3Q9BXJ4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1QTNF3Q9BXJ4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1QTNF3Q9BXJ4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1QTNF3Q9BXJ4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1QTNF3Q9BXJ4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QTNF3Q9BXJ4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QTNF3Q9BXJ4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QTNF3Q9BXJ4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QTNF3Q9BXJ4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QTNF3Q9BXJ4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1QTNF3Q9BXJ4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1QTNF3Q9BXJ4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms