Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWQ6

YIPF2, Protein YIPF2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF2Q9BWQ6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
YIPF2Q9BWQ6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
YIPF2Q9BWQ6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YIPF2Q9BWQ6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YIPF2Q9BWQ6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YIPF2Q9BWQ6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YIPF2Q9BWQ6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YIPF2Q9BWQ6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YIPF2Q9BWQ6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YIPF2Q9BWQ6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YIPF2Q9BWQ6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YIPF2Q9BWQ6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YIPF2Q9BWQ6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YIPF2Q9BWQ6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YIPF2Q9BWQ6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YIPF2Q9BWQ6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YIPF2Q9BWQ6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF2Q9BWQ6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF2Q9BWQ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
YIPF2Q9BWQ6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YIPF2Q9BWQ6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YIPF2Q9BWQ6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YIPF2Q9BWQ6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YIPF2Q9BWQ6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YIPF2Q9BWQ6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YIPF2Q9BWQ6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YIPF2Q9BWQ6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YIPF2Q9BWQ6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YIPF2Q9BWQ6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YIPF2Q9BWQ6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YIPF2Q9BWQ6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YIPF2Q9BWQ6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YIPF2Q9BWQ6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YIPF2Q9BWQ6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YIPF2Q9BWQ6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YIPF2Q9BWQ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YIPF2Q9BWQ6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YIPF2Q9BWQ6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YIPF2Q9BWQ6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
YIPF2Q9BWQ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
YIPF2Q9BWQ6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YIPF2Q9BWQ6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YIPF2Q9BWQ6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YIPF2Q9BWQ6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YIPF2Q9BWQ6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YIPF2Q9BWQ6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YIPF2Q9BWQ6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YIPF2Q9BWQ6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YIPF2Q9BWQ6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YIPF2Q9BWQ6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YIPF2Q9BWQ6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YIPF2Q9BWQ6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YIPF2Q9BWQ6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YIPF2Q9BWQ6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YIPF2Q9BWQ6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YIPF2Q9BWQ6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YIPF2Q9BWQ6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
YIPF2Q9BWQ6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YIPF2Q9BWQ6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YIPF2Q9BWQ6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms