Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV20

MRI1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRI1Q9BV20 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRI1Q9BV20 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRI1Q9BV20 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRI1Q9BV20 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRI1Q9BV20 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRI1Q9BV20 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRI1Q9BV20 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRI1Q9BV20 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRI1Q9BV20 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRI1Q9BV20 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRI1Q9BV20 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRI1Q9BV20 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRI1Q9BV20 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRI1Q9BV20 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRI1Q9BV20 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRI1Q9BV20 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRI1Q9BV20 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRI1Q9BV20 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MRI1Q9BV20 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRI1Q9BV20 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRI1Q9BV20 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MRI1Q9BV20 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRI1Q9BV20 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRI1Q9BV20 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRI1Q9BV20 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRI1Q9BV20 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRI1Q9BV20 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRI1Q9BV20 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRI1Q9BV20 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRI1Q9BV20 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRI1Q9BV20 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRI1Q9BV20 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRI1Q9BV20 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRI1Q9BV20 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRI1Q9BV20 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MRI1Q9BV20 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MRI1Q9BV20 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms