Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRACR2AQ9BSW2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRACR2AQ9BSW2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRACR2AQ9BSW2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRACR2AQ9BSW2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRACR2AQ9BSW2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRACR2AQ9BSW2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRACR2AQ9BSW2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRACR2AQ9BSW2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRACR2AQ9BSW2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRACR2AQ9BSW2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRACR2AQ9BSW2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRACR2AQ9BSW2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRACR2AQ9BSW2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRACR2AQ9BSW2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CRACR2AQ9BSW2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRACR2AQ9BSW2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRACR2AQ9BSW2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CRACR2AQ9BSW2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CRACR2AQ9BSW2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CRACR2AQ9BSW2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CRACR2AQ9BSW2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRACR2AQ9BSW2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRACR2AQ9BSW2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CRACR2AQ9BSW2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CRACR2AQ9BSW2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CRACR2AQ9BSW2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRACR2AQ9BSW2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRACR2AQ9BSW2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRACR2AQ9BSW2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRACR2AQ9BSW2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRACR2AQ9BSW2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRACR2AQ9BSW2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRACR2AQ9BSW2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRACR2AQ9BSW2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRACR2AQ9BSW2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CRACR2AQ9BSW2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CRACR2AQ9BSW2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRACR2AQ9BSW2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRACR2AQ9BSW2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRACR2AQ9BSW2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRACR2AQ9BSW2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRACR2AQ9BSW2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRACR2AQ9BSW2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRACR2AQ9BSW2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRACR2AQ9BSW2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRACR2AQ9BSW2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRACR2AQ9BSW2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRACR2AQ9BSW2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRACR2AQ9BSW2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRACR2AQ9BSW2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRACR2AQ9BSW2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRACR2AQ9BSW2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRACR2AQ9BSW2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRACR2AQ9BSW2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRACR2AQ9BSW2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CRACR2AQ9BSW2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRACR2AQ9BSW2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRACR2AQ9BSW2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRACR2AQ9BSW2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRACR2AQ9BSW2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRACR2AQ9BSW2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRACR2AQ9BSW2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRACR2AQ9BSW2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRACR2AQ9BSW2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRACR2AQ9BSW2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRACR2AQ9BSW2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRACR2AQ9BSW2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRACR2AQ9BSW2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CRACR2AQ9BSW2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CRACR2AQ9BSW2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRACR2AQ9BSW2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRACR2AQ9BSW2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms