Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPKQ9BS16 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPKQ9BS16 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPKQ9BS16 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPKQ9BS16 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPKQ9BS16 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPKQ9BS16 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPKQ9BS16 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPKQ9BS16 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPKQ9BS16 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPKQ9BS16 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPKQ9BS16 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPKQ9BS16 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPKQ9BS16 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPKQ9BS16 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPKQ9BS16 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPKQ9BS16 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPKQ9BS16 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPKQ9BS16 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPKQ9BS16 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPKQ9BS16 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPKQ9BS16 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPKQ9BS16 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPKQ9BS16 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPKQ9BS16 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPKQ9BS16 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPKQ9BS16 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPKQ9BS16 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPKQ9BS16 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPKQ9BS16 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPKQ9BS16 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CENPKQ9BS16 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPKQ9BS16 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPKQ9BS16 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPKQ9BS16 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPKQ9BS16 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPKQ9BS16 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPKQ9BS16 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPKQ9BS16 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPKQ9BS16 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 627 ms