Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF8Q9BRL6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF8Q9BRL6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF8Q9BRL6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF8Q9BRL6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF8Q9BRL6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF8Q9BRL6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF8Q9BRL6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF8Q9BRL6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF8Q9BRL6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF8Q9BRL6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms