Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TREX2Q9BQ50 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TREX2Q9BQ50 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TREX2Q9BQ50 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TREX2Q9BQ50 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TREX2Q9BQ50 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TREX2Q9BQ50 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TREX2Q9BQ50 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TREX2Q9BQ50 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TREX2Q9BQ50 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TREX2Q9BQ50 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TREX2Q9BQ50 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TREX2Q9BQ50 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TREX2Q9BQ50 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TREX2Q9BQ50 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TREX2Q9BQ50 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TREX2Q9BQ50 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TREX2Q9BQ50 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TREX2Q9BQ50 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TREX2Q9BQ50 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TREX2Q9BQ50 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TREX2Q9BQ50 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TREX2Q9BQ50 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TREX2Q9BQ50 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TREX2Q9BQ50 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TREX2Q9BQ50 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TREX2Q9BQ50 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TREX2Q9BQ50 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TREX2Q9BQ50 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TREX2Q9BQ50 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TREX2Q9BQ50 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TREX2Q9BQ50 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TREX2Q9BQ50 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TREX2Q9BQ50 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TREX2Q9BQ50 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TREX2Q9BQ50 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TREX2Q9BQ50 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TREX2Q9BQ50 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TREX2Q9BQ50 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TREX2Q9BQ50 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TREX2Q9BQ50 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TREX2Q9BQ50 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TREX2Q9BQ50 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TREX2Q9BQ50 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TREX2Q9BQ50 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TREX2Q9BQ50 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TREX2Q9BQ50 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TREX2Q9BQ50 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TREX2Q9BQ50 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms