Protein–RNA interactions for Protein: Q99961

SH3GL1, Endophilin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1Q99961 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3GL1Q99961 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GL1Q99961 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH3GL1Q99961 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GL1Q99961 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GL1Q99961 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GL1Q99961 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GL1Q99961 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GL1Q99961 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GL1Q99961 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GL1Q99961 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GL1Q99961 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GL1Q99961 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GL1Q99961 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GL1Q99961 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GL1Q99961 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GL1Q99961 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GL1Q99961 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GL1Q99961 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GL1Q99961 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3GL1Q99961 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3GL1Q99961 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3GL1Q99961 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3GL1Q99961 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms