Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC1Q99614 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC1Q99614 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC1Q99614 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC1Q99614 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TTC1Q99614 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC1Q99614 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC1Q99614 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC1Q99614 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC1Q99614 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC1Q99614 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC1Q99614 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC1Q99614 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC1Q99614 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC1Q99614 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC1Q99614 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC1Q99614 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC1Q99614 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC1Q99614 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC1Q99614 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC1Q99614 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC1Q99614 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC1Q99614 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC1Q99614 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC1Q99614 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC1Q99614 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC1Q99614 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC1Q99614 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC1Q99614 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC1Q99614 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC1Q99614 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC1Q99614 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC1Q99614 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC1Q99614 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC1Q99614 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC1Q99614 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC1Q99614 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TTC1Q99614 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC1Q99614 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC1Q99614 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC1Q99614 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC1Q99614 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC1Q99614 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC1Q99614 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC1Q99614 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC1Q99614 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC1Q99614 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC1Q99614 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC1Q99614 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC1Q99614 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC1Q99614 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC1Q99614 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC1Q99614 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC1Q99614 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms