Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHOX2BQ99453 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHOX2BQ99453 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHOX2BQ99453 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PHOX2BQ99453 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PHOX2BQ99453 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHOX2BQ99453 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHOX2BQ99453 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHOX2BQ99453 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHOX2BQ99453 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHOX2BQ99453 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHOX2BQ99453 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHOX2BQ99453 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHOX2BQ99453 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHOX2BQ99453 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHOX2BQ99453 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHOX2BQ99453 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHOX2BQ99453 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHOX2BQ99453 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PHOX2BQ99453 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHOX2BQ99453 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHOX2BQ99453 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHOX2BQ99453 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHOX2BQ99453 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHOX2BQ99453 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHOX2BQ99453 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHOX2BQ99453 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHOX2BQ99453 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHOX2BQ99453 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHOX2BQ99453 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHOX2BQ99453 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHOX2BQ99453 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PHOX2BQ99453 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHOX2BQ99453 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHOX2BQ99453 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHOX2BQ99453 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHOX2BQ99453 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHOX2BQ99453 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHOX2BQ99453 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHOX2BQ99453 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHOX2BQ99453 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHOX2BQ99453 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHOX2BQ99453 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHOX2BQ99453 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHOX2BQ99453 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHOX2BQ99453 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHOX2BQ99453 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHOX2BQ99453 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHOX2BQ99453 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHOX2BQ99453 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHOX2BQ99453 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHOX2BQ99453 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHOX2BQ99453 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PHOX2BQ99453 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHOX2BQ99453 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHOX2BQ99453 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHOX2BQ99453 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHOX2BQ99453 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHOX2BQ99453 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHOX2BQ99453 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHOX2BQ99453 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHOX2BQ99453 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHOX2BQ99453 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHOX2BQ99453 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHOX2BQ99453 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHOX2BQ99453 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHOX2BQ99453 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHOX2BQ99453 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHOX2BQ99453 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHOX2BQ99453 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHOX2BQ99453 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHOX2BQ99453 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHOX2BQ99453 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHOX2BQ99453 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHOX2BQ99453 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHOX2BQ99453 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHOX2BQ99453 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHOX2BQ99453 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHOX2BQ99453 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHOX2BQ99453 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHOX2BQ99453 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHOX2BQ99453 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHOX2BQ99453 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHOX2BQ99453 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHOX2BQ99453 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHOX2BQ99453 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHOX2BQ99453 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHOX2BQ99453 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHOX2BQ99453 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PHOX2BQ99453 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHOX2BQ99453 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHOX2BQ99453 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHOX2BQ99453 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHOX2BQ99453 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHOX2BQ99453 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHOX2BQ99453 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PHOX2BQ99453 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHOX2BQ99453 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHOX2BQ99453 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHOX2BQ99453 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms