Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL2Q96S94 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL2Q96S94 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNL2Q96S94 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNL2Q96S94 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNL2Q96S94 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNL2Q96S94 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL2Q96S94 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL2Q96S94 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL2Q96S94 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL2Q96S94 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL2Q96S94 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL2Q96S94 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNL2Q96S94 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNL2Q96S94 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNL2Q96S94 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNL2Q96S94 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNL2Q96S94 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCNL2Q96S94 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNL2Q96S94 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNL2Q96S94 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNL2Q96S94 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNL2Q96S94 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNL2Q96S94 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNL2Q96S94 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNL2Q96S94 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNL2Q96S94 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNL2Q96S94 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL2Q96S94 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL2Q96S94 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL2Q96S94 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL2Q96S94 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNL2Q96S94 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNL2Q96S94 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNL2Q96S94 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNL2Q96S94 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNL2Q96S94 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL2Q96S94 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL2Q96S94 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNL2Q96S94 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCNL2Q96S94 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNL2Q96S94 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNL2Q96S94 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL2Q96S94 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL2Q96S94 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL2Q96S94 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL2Q96S94 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL2Q96S94 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNL2Q96S94 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms