Protein–RNA interactions for Protein: Q96QI5

HS3ST6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST6Q96QI5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS3ST6Q96QI5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HS3ST6Q96QI5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS3ST6Q96QI5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HS3ST6Q96QI5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms