Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
LMTK3Q96Q04 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
LMTK3Q96Q04 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
LMTK3Q96Q04 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
LMTK3Q96Q04 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
LMTK3Q96Q04 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
LMTK3Q96Q04 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
LMTK3Q96Q04 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
LMTK3Q96Q04 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
LMTK3Q96Q04 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
LMTK3Q96Q04 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
LMTK3Q96Q04 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
LMTK3Q96Q04 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
LMTK3Q96Q04 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
LMTK3Q96Q04 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
LMTK3Q96Q04 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
LMTK3Q96Q04 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38.73■■■■□ 3.79
LMTK3Q96Q04 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
LMTK3Q96Q04 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
LMTK3Q96Q04 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
LMTK3Q96Q04 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
LMTK3Q96Q04 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
LMTK3Q96Q04 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
LMTK3Q96Q04 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
LMTK3Q96Q04 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
LMTK3Q96Q04 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
LMTK3Q96Q04 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.67■■■■□ 3.78
LMTK3Q96Q04 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
LMTK3Q96Q04 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
LMTK3Q96Q04 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
LMTK3Q96Q04 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
LMTK3Q96Q04 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
LMTK3Q96Q04 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
LMTK3Q96Q04 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
LMTK3Q96Q04 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
LMTK3Q96Q04 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
LMTK3Q96Q04 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
LMTK3Q96Q04 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
LMTK3Q96Q04 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
LMTK3Q96Q04 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
LMTK3Q96Q04 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
LMTK3Q96Q04 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
LMTK3Q96Q04 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
LMTK3Q96Q04 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
LMTK3Q96Q04 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
LMTK3Q96Q04 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.76
LMTK3Q96Q04 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
LMTK3Q96Q04 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
LMTK3Q96Q04 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
LMTK3Q96Q04 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
LMTK3Q96Q04 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
LMTK3Q96Q04 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
LMTK3Q96Q04 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.54■■■■□ 3.76
LMTK3Q96Q04 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
LMTK3Q96Q04 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
LMTK3Q96Q04 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
LMTK3Q96Q04 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
LMTK3Q96Q04 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
LMTK3Q96Q04 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
LMTK3Q96Q04 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
LMTK3Q96Q04 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
LMTK3Q96Q04 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
LMTK3Q96Q04 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
LMTK3Q96Q04 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
LMTK3Q96Q04 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
LMTK3Q96Q04 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
LMTK3Q96Q04 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
LMTK3Q96Q04 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
LMTK3Q96Q04 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
LMTK3Q96Q04 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
LMTK3Q96Q04 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
LMTK3Q96Q04 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
LMTK3Q96Q04 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
LMTK3Q96Q04 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
LMTK3Q96Q04 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
LMTK3Q96Q04 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
LMTK3Q96Q04 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
LMTK3Q96Q04 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
LMTK3Q96Q04 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
LMTK3Q96Q04 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
LMTK3Q96Q04 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
LMTK3Q96Q04 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
LMTK3Q96Q04 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
LMTK3Q96Q04 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
LMTK3Q96Q04 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
LMTK3Q96Q04 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
LMTK3Q96Q04 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
LMTK3Q96Q04 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
LMTK3Q96Q04 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
LMTK3Q96Q04 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
LMTK3Q96Q04 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
LMTK3Q96Q04 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
LMTK3Q96Q04 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
LMTK3Q96Q04 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
LMTK3Q96Q04 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
LMTK3Q96Q04 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
LMTK3Q96Q04 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
LMTK3Q96Q04 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
LMTK3Q96Q04 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
LMTK3Q96Q04 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms