Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCEEQ96PE7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCEEQ96PE7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCEEQ96PE7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCEEQ96PE7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCEEQ96PE7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCEEQ96PE7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MCEEQ96PE7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MCEEQ96PE7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCEEQ96PE7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCEEQ96PE7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCEEQ96PE7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCEEQ96PE7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCEEQ96PE7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCEEQ96PE7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCEEQ96PE7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCEEQ96PE7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCEEQ96PE7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCEEQ96PE7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCEEQ96PE7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCEEQ96PE7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCEEQ96PE7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCEEQ96PE7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCEEQ96PE7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCEEQ96PE7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCEEQ96PE7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MCEEQ96PE7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCEEQ96PE7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCEEQ96PE7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCEEQ96PE7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCEEQ96PE7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCEEQ96PE7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCEEQ96PE7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCEEQ96PE7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCEEQ96PE7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCEEQ96PE7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MCEEQ96PE7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MCEEQ96PE7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCEEQ96PE7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCEEQ96PE7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCEEQ96PE7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCEEQ96PE7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MCEEQ96PE7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCEEQ96PE7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCEEQ96PE7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCEEQ96PE7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCEEQ96PE7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCEEQ96PE7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCEEQ96PE7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MCEEQ96PE7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCEEQ96PE7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MCEEQ96PE7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCEEQ96PE7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCEEQ96PE7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCEEQ96PE7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCEEQ96PE7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCEEQ96PE7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCEEQ96PE7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCEEQ96PE7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCEEQ96PE7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCEEQ96PE7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCEEQ96PE7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCEEQ96PE7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCEEQ96PE7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCEEQ96PE7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCEEQ96PE7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCEEQ96PE7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCEEQ96PE7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCEEQ96PE7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCEEQ96PE7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCEEQ96PE7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCEEQ96PE7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MCEEQ96PE7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCEEQ96PE7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms