Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PGLYRP2Q96PD5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PGLYRP2Q96PD5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PGLYRP2Q96PD5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PGLYRP2Q96PD5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PGLYRP2Q96PD5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGLYRP2Q96PD5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGLYRP2Q96PD5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGLYRP2Q96PD5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGLYRP2Q96PD5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGLYRP2Q96PD5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGLYRP2Q96PD5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGLYRP2Q96PD5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGLYRP2Q96PD5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PGLYRP2Q96PD5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGLYRP2Q96PD5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PGLYRP2Q96PD5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PGLYRP2Q96PD5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PGLYRP2Q96PD5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PGLYRP2Q96PD5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PGLYRP2Q96PD5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PGLYRP2Q96PD5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PGLYRP2Q96PD5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PGLYRP2Q96PD5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PGLYRP2Q96PD5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PGLYRP2Q96PD5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PGLYRP2Q96PD5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PGLYRP2Q96PD5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PGLYRP2Q96PD5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PGLYRP2Q96PD5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PGLYRP2Q96PD5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PGLYRP2Q96PD5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PGLYRP2Q96PD5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PGLYRP2Q96PD5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PGLYRP2Q96PD5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PGLYRP2Q96PD5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PGLYRP2Q96PD5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PGLYRP2Q96PD5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PGLYRP2Q96PD5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PGLYRP2Q96PD5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PGLYRP2Q96PD5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PGLYRP2Q96PD5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGLYRP2Q96PD5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGLYRP2Q96PD5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGLYRP2Q96PD5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PGLYRP2Q96PD5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PGLYRP2Q96PD5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PGLYRP2Q96PD5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PGLYRP2Q96PD5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PGLYRP2Q96PD5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PGLYRP2Q96PD5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PGLYRP2Q96PD5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PGLYRP2Q96PD5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PGLYRP2Q96PD5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PGLYRP2Q96PD5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PGLYRP2Q96PD5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PGLYRP2Q96PD5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PGLYRP2Q96PD5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PGLYRP2Q96PD5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PGLYRP2Q96PD5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PGLYRP2Q96PD5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PGLYRP2Q96PD5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PGLYRP2Q96PD5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGLYRP2Q96PD5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGLYRP2Q96PD5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGLYRP2Q96PD5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PGLYRP2Q96PD5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGLYRP2Q96PD5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PGLYRP2Q96PD5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PGLYRP2Q96PD5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PGLYRP2Q96PD5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PGLYRP2Q96PD5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PGLYRP2Q96PD5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PGLYRP2Q96PD5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms