Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RILPQ96NA2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RILPQ96NA2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RILPQ96NA2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RILPQ96NA2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RILPQ96NA2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RILPQ96NA2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RILPQ96NA2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RILPQ96NA2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RILPQ96NA2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RILPQ96NA2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RILPQ96NA2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RILPQ96NA2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RILPQ96NA2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RILPQ96NA2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RILPQ96NA2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RILPQ96NA2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RILPQ96NA2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RILPQ96NA2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RILPQ96NA2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RILPQ96NA2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RILPQ96NA2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RILPQ96NA2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RILPQ96NA2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RILPQ96NA2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RILPQ96NA2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RILPQ96NA2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RILPQ96NA2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RILPQ96NA2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RILPQ96NA2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RILPQ96NA2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RILPQ96NA2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RILPQ96NA2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RILPQ96NA2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RILPQ96NA2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RILPQ96NA2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RILPQ96NA2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RILPQ96NA2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RILPQ96NA2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RILPQ96NA2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RILPQ96NA2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RILPQ96NA2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RILPQ96NA2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RILPQ96NA2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RILPQ96NA2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RILPQ96NA2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RILPQ96NA2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RILPQ96NA2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RILPQ96NA2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RILPQ96NA2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RILPQ96NA2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RILPQ96NA2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RILPQ96NA2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RILPQ96NA2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RILPQ96NA2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RILPQ96NA2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RILPQ96NA2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RILPQ96NA2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RILPQ96NA2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RILPQ96NA2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RILPQ96NA2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RILPQ96NA2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RILPQ96NA2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RILPQ96NA2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RILPQ96NA2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RILPQ96NA2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RILPQ96NA2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RILPQ96NA2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RILPQ96NA2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RILPQ96NA2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RILPQ96NA2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RILPQ96NA2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms