Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C9orf72Q96LT7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C9orf72Q96LT7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C9orf72Q96LT7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C9orf72Q96LT7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C9orf72Q96LT7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C9orf72Q96LT7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C9orf72Q96LT7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C9orf72Q96LT7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
C9orf72Q96LT7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C9orf72Q96LT7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C9orf72Q96LT7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C9orf72Q96LT7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C9orf72Q96LT7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C9orf72Q96LT7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf72Q96LT7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C9orf72Q96LT7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C9orf72Q96LT7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C9orf72Q96LT7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C9orf72Q96LT7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
C9orf72Q96LT7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
C9orf72Q96LT7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C9orf72Q96LT7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C9orf72Q96LT7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C9orf72Q96LT7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms