Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFT74Q96LB3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFT74Q96LB3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT74Q96LB3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT74Q96LB3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT74Q96LB3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT74Q96LB3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT74Q96LB3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFT74Q96LB3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFT74Q96LB3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
IFT74Q96LB3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IFT74Q96LB3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IFT74Q96LB3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFT74Q96LB3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFT74Q96LB3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
IFT74Q96LB3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IFT74Q96LB3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IFT74Q96LB3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT74Q96LB3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT74Q96LB3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT74Q96LB3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT74Q96LB3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT74Q96LB3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT74Q96LB3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT74Q96LB3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT74Q96LB3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT74Q96LB3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
IFT74Q96LB3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
IFT74Q96LB3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT74Q96LB3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT74Q96LB3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT74Q96LB3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT74Q96LB3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT74Q96LB3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT74Q96LB3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT74Q96LB3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT74Q96LB3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT74Q96LB3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT74Q96LB3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT74Q96LB3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT74Q96LB3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT74Q96LB3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT74Q96LB3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT74Q96LB3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT74Q96LB3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT74Q96LB3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT74Q96LB3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT74Q96LB3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT74Q96LB3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT74Q96LB3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT74Q96LB3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT74Q96LB3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT74Q96LB3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT74Q96LB3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT74Q96LB3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFT74Q96LB3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFT74Q96LB3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFT74Q96LB3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT74Q96LB3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT74Q96LB3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT74Q96LB3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT74Q96LB3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT74Q96LB3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IFT74Q96LB3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
IFT74Q96LB3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFT74Q96LB3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFT74Q96LB3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFT74Q96LB3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
IFT74Q96LB3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
IFT74Q96LB3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFT74Q96LB3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFT74Q96LB3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFT74Q96LB3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms