Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCHS1Q96JQ0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCHS1Q96JQ0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCHS1Q96JQ0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCHS1Q96JQ0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCHS1Q96JQ0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCHS1Q96JQ0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCHS1Q96JQ0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCHS1Q96JQ0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCHS1Q96JQ0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCHS1Q96JQ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCHS1Q96JQ0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCHS1Q96JQ0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCHS1Q96JQ0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCHS1Q96JQ0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCHS1Q96JQ0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCHS1Q96JQ0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DCHS1Q96JQ0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
DCHS1Q96JQ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCHS1Q96JQ0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCHS1Q96JQ0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCHS1Q96JQ0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCHS1Q96JQ0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCHS1Q96JQ0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCHS1Q96JQ0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCHS1Q96JQ0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCHS1Q96JQ0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCHS1Q96JQ0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCHS1Q96JQ0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCHS1Q96JQ0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCHS1Q96JQ0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCHS1Q96JQ0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCHS1Q96JQ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCHS1Q96JQ0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCHS1Q96JQ0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCHS1Q96JQ0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCHS1Q96JQ0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DCHS1Q96JQ0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DCHS1Q96JQ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCHS1Q96JQ0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DCHS1Q96JQ0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCHS1Q96JQ0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCHS1Q96JQ0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCHS1Q96JQ0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCHS1Q96JQ0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCHS1Q96JQ0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCHS1Q96JQ0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCHS1Q96JQ0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCHS1Q96JQ0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCHS1Q96JQ0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCHS1Q96JQ0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCHS1Q96JQ0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCHS1Q96JQ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCHS1Q96JQ0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCHS1Q96JQ0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCHS1Q96JQ0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCHS1Q96JQ0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCHS1Q96JQ0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCHS1Q96JQ0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCHS1Q96JQ0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCHS1Q96JQ0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCHS1Q96JQ0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCHS1Q96JQ0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCHS1Q96JQ0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCHS1Q96JQ0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCHS1Q96JQ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCHS1Q96JQ0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCHS1Q96JQ0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCHS1Q96JQ0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DCHS1Q96JQ0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCHS1Q96JQ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCHS1Q96JQ0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCHS1Q96JQ0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCHS1Q96JQ0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCHS1Q96JQ0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCHS1Q96JQ0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCHS1Q96JQ0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCHS1Q96JQ0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCHS1Q96JQ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCHS1Q96JQ0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCHS1Q96JQ0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCHS1Q96JQ0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCHS1Q96JQ0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCHS1Q96JQ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCHS1Q96JQ0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCHS1Q96JQ0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCHS1Q96JQ0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
DCHS1Q96JQ0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
DCHS1Q96JQ0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCHS1Q96JQ0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCHS1Q96JQ0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCHS1Q96JQ0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DCHS1Q96JQ0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCHS1Q96JQ0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCHS1Q96JQ0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DCHS1Q96JQ0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCHS1Q96JQ0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCHS1Q96JQ0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCHS1Q96JQ0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCHS1Q96JQ0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms