Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRIG1Q96JA1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRIG1Q96JA1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRIG1Q96JA1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRIG1Q96JA1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRIG1Q96JA1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRIG1Q96JA1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRIG1Q96JA1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRIG1Q96JA1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRIG1Q96JA1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRIG1Q96JA1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRIG1Q96JA1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRIG1Q96JA1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRIG1Q96JA1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRIG1Q96JA1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRIG1Q96JA1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRIG1Q96JA1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRIG1Q96JA1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRIG1Q96JA1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRIG1Q96JA1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRIG1Q96JA1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRIG1Q96JA1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRIG1Q96JA1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRIG1Q96JA1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRIG1Q96JA1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRIG1Q96JA1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRIG1Q96JA1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRIG1Q96JA1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRIG1Q96JA1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRIG1Q96JA1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRIG1Q96JA1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LRIG1Q96JA1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIG1Q96JA1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIG1Q96JA1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIG1Q96JA1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIG1Q96JA1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRIG1Q96JA1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRIG1Q96JA1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRIG1Q96JA1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRIG1Q96JA1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms