Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRELD1Q96HD1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRELD1Q96HD1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRELD1Q96HD1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRELD1Q96HD1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRELD1Q96HD1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CRELD1Q96HD1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRELD1Q96HD1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRELD1Q96HD1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRELD1Q96HD1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRELD1Q96HD1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRELD1Q96HD1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRELD1Q96HD1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CRELD1Q96HD1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRELD1Q96HD1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRELD1Q96HD1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRELD1Q96HD1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRELD1Q96HD1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CRELD1Q96HD1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CRELD1Q96HD1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRELD1Q96HD1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms