Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SHISA4Q96DD7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SHISA4Q96DD7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SHISA4Q96DD7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
SHISA4Q96DD7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SHISA4Q96DD7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SHISA4Q96DD7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHISA4Q96DD7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHISA4Q96DD7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHISA4Q96DD7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHISA4Q96DD7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHISA4Q96DD7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHISA4Q96DD7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHISA4Q96DD7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHISA4Q96DD7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHISA4Q96DD7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHISA4Q96DD7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHISA4Q96DD7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHISA4Q96DD7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHISA4Q96DD7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SHISA4Q96DD7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHISA4Q96DD7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHISA4Q96DD7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHISA4Q96DD7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHISA4Q96DD7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHISA4Q96DD7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHISA4Q96DD7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SHISA4Q96DD7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SHISA4Q96DD7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SHISA4Q96DD7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHISA4Q96DD7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHISA4Q96DD7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHISA4Q96DD7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SHISA4Q96DD7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SHISA4Q96DD7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SHISA4Q96DD7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHISA4Q96DD7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SHISA4Q96DD7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SHISA4Q96DD7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SHISA4Q96DD7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SHISA4Q96DD7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SHISA4Q96DD7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SHISA4Q96DD7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SHISA4Q96DD7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SHISA4Q96DD7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SHISA4Q96DD7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SHISA4Q96DD7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHISA4Q96DD7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHISA4Q96DD7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHISA4Q96DD7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHISA4Q96DD7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SHISA4Q96DD7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHISA4Q96DD7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHISA4Q96DD7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHISA4Q96DD7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHISA4Q96DD7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SHISA4Q96DD7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SHISA4Q96DD7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHISA4Q96DD7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHISA4Q96DD7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SHISA4Q96DD7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHISA4Q96DD7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHISA4Q96DD7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SHISA4Q96DD7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHISA4Q96DD7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SHISA4Q96DD7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SHISA4Q96DD7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SHISA4Q96DD7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHISA4Q96DD7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHISA4Q96DD7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHISA4Q96DD7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHISA4Q96DD7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHISA4Q96DD7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SHISA4Q96DD7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SHISA4Q96DD7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SHISA4Q96DD7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHISA4Q96DD7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SHISA4Q96DD7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SHISA4Q96DD7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SHISA4Q96DD7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHISA4Q96DD7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHISA4Q96DD7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SHISA4Q96DD7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHISA4Q96DD7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHISA4Q96DD7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHISA4Q96DD7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHISA4Q96DD7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHISA4Q96DD7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SHISA4Q96DD7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SHISA4Q96DD7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SHISA4Q96DD7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHISA4Q96DD7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHISA4Q96DD7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHISA4Q96DD7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHISA4Q96DD7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SHISA4Q96DD7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SHISA4Q96DD7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.2 ms