Protein–RNA interactions for Protein: Q96D71

REPS1, RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1Q96D71 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
REPS1Q96D71 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REPS1Q96D71 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
REPS1Q96D71 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REPS1Q96D71 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
REPS1Q96D71 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
REPS1Q96D71 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
REPS1Q96D71 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
REPS1Q96D71 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
REPS1Q96D71 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
REPS1Q96D71 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
REPS1Q96D71 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
REPS1Q96D71 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
REPS1Q96D71 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
REPS1Q96D71 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
REPS1Q96D71 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
REPS1Q96D71 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
REPS1Q96D71 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
REPS1Q96D71 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
REPS1Q96D71 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
REPS1Q96D71 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
REPS1Q96D71 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
REPS1Q96D71 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
REPS1Q96D71 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
REPS1Q96D71 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
REPS1Q96D71 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
REPS1Q96D71 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
REPS1Q96D71 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
REPS1Q96D71 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
REPS1Q96D71 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
REPS1Q96D71 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REPS1Q96D71 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
REPS1Q96D71 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REPS1Q96D71 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
REPS1Q96D71 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
REPS1Q96D71 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REPS1Q96D71 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
REPS1Q96D71 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REPS1Q96D71 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REPS1Q96D71 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
REPS1Q96D71 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REPS1Q96D71 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REPS1Q96D71 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REPS1Q96D71 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REPS1Q96D71 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
REPS1Q96D71 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REPS1Q96D71 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REPS1Q96D71 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
REPS1Q96D71 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REPS1Q96D71 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
REPS1Q96D71 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REPS1Q96D71 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
REPS1Q96D71 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REPS1Q96D71 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REPS1Q96D71 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REPS1Q96D71 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
REPS1Q96D71 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REPS1Q96D71 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
REPS1Q96D71 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
REPS1Q96D71 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REPS1Q96D71 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
REPS1Q96D71 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
REPS1Q96D71 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
REPS1Q96D71 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REPS1Q96D71 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
REPS1Q96D71 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REPS1Q96D71 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REPS1Q96D71 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
REPS1Q96D71 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
REPS1Q96D71 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
REPS1Q96D71 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
REPS1Q96D71 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
REPS1Q96D71 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
REPS1Q96D71 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
REPS1Q96D71 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REPS1Q96D71 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REPS1Q96D71 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms