Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
OPTNQ96CV9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
OPTNQ96CV9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
OPTNQ96CV9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
OPTNQ96CV9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
OPTNQ96CV9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
OPTNQ96CV9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
OPTNQ96CV9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
OPTNQ96CV9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
OPTNQ96CV9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
OPTNQ96CV9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
OPTNQ96CV9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
OPTNQ96CV9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
OPTNQ96CV9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
OPTNQ96CV9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
OPTNQ96CV9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
OPTNQ96CV9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
OPTNQ96CV9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
OPTNQ96CV9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
OPTNQ96CV9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
OPTNQ96CV9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
OPTNQ96CV9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
OPTNQ96CV9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
OPTNQ96CV9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
OPTNQ96CV9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
OPTNQ96CV9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
OPTNQ96CV9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
OPTNQ96CV9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
OPTNQ96CV9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
OPTNQ96CV9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
OPTNQ96CV9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
OPTNQ96CV9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
OPTNQ96CV9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
OPTNQ96CV9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
OPTNQ96CV9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
OPTNQ96CV9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
OPTNQ96CV9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
OPTNQ96CV9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
OPTNQ96CV9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
OPTNQ96CV9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
OPTNQ96CV9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
OPTNQ96CV9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
OPTNQ96CV9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
OPTNQ96CV9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
OPTNQ96CV9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
OPTNQ96CV9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
OPTNQ96CV9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
OPTNQ96CV9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
OPTNQ96CV9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
OPTNQ96CV9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
OPTNQ96CV9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
OPTNQ96CV9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
OPTNQ96CV9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
OPTNQ96CV9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
OPTNQ96CV9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
OPTNQ96CV9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
OPTNQ96CV9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
OPTNQ96CV9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
OPTNQ96CV9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
OPTNQ96CV9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
OPTNQ96CV9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
OPTNQ96CV9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
OPTNQ96CV9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
OPTNQ96CV9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
OPTNQ96CV9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
OPTNQ96CV9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
OPTNQ96CV9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
OPTNQ96CV9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
OPTNQ96CV9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
OPTNQ96CV9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
OPTNQ96CV9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
OPTNQ96CV9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
OPTNQ96CV9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
OPTNQ96CV9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
OPTNQ96CV9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
OPTNQ96CV9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
OPTNQ96CV9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
OPTNQ96CV9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
OPTNQ96CV9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
OPTNQ96CV9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
OPTNQ96CV9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
OPTNQ96CV9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
OPTNQ96CV9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
OPTNQ96CV9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
OPTNQ96CV9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
OPTNQ96CV9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
OPTNQ96CV9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
OPTNQ96CV9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
OPTNQ96CV9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
OPTNQ96CV9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
OPTNQ96CV9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
OPTNQ96CV9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
OPTNQ96CV9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
OPTNQ96CV9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
OPTNQ96CV9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
OPTNQ96CV9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
OPTNQ96CV9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
OPTNQ96CV9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
OPTNQ96CV9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
OPTNQ96CV9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms