Protein–RNA interactions for Protein: Q96CU9

FOXRED1, FAD-dependent oxidoreductase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXRED1Q96CU9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXRED1Q96CU9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXRED1Q96CU9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXRED1Q96CU9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXRED1Q96CU9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXRED1Q96CU9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXRED1Q96CU9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXRED1Q96CU9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXRED1Q96CU9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXRED1Q96CU9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXRED1Q96CU9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXRED1Q96CU9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXRED1Q96CU9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXRED1Q96CU9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXRED1Q96CU9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXRED1Q96CU9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXRED1Q96CU9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXRED1Q96CU9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXRED1Q96CU9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXRED1Q96CU9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXRED1Q96CU9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXRED1Q96CU9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXRED1Q96CU9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms