Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD5

PHF21A, PHD finger protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21AQ96BD5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF21AQ96BD5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF21AQ96BD5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF21AQ96BD5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF21AQ96BD5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF21AQ96BD5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF21AQ96BD5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF21AQ96BD5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF21AQ96BD5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF21AQ96BD5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF21AQ96BD5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF21AQ96BD5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF21AQ96BD5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF21AQ96BD5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF21AQ96BD5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF21AQ96BD5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF21AQ96BD5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF21AQ96BD5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF21AQ96BD5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF21AQ96BD5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF21AQ96BD5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF21AQ96BD5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF21AQ96BD5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF21AQ96BD5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF21AQ96BD5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF21AQ96BD5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF21AQ96BD5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF21AQ96BD5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF21AQ96BD5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF21AQ96BD5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF21AQ96BD5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF21AQ96BD5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHF21AQ96BD5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms