Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HPS3Q969F9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HPS3Q969F9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
HPS3Q969F9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
HPS3Q969F9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HPS3Q969F9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HPS3Q969F9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HPS3Q969F9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HPS3Q969F9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HPS3Q969F9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPS3Q969F9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPS3Q969F9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HPS3Q969F9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HPS3Q969F9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HPS3Q969F9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HPS3Q969F9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HPS3Q969F9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
HPS3Q969F9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HPS3Q969F9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HPS3Q969F9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HPS3Q969F9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HPS3Q969F9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HPS3Q969F9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HPS3Q969F9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HPS3Q969F9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HPS3Q969F9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HPS3Q969F9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HPS3Q969F9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HPS3Q969F9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HPS3Q969F9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HPS3Q969F9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HPS3Q969F9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HPS3Q969F9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HPS3Q969F9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HPS3Q969F9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HPS3Q969F9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HPS3Q969F9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HPS3Q969F9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HPS3Q969F9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HPS3Q969F9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HPS3Q969F9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HPS3Q969F9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HPS3Q969F9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HPS3Q969F9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HPS3Q969F9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HPS3Q969F9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HPS3Q969F9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HPS3Q969F9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HPS3Q969F9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HPS3Q969F9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HPS3Q969F9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HPS3Q969F9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HPS3Q969F9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HPS3Q969F9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HPS3Q969F9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HPS3Q969F9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HPS3Q969F9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HPS3Q969F9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HPS3Q969F9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HPS3Q969F9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HPS3Q969F9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HPS3Q969F9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HPS3Q969F9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HPS3Q969F9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HPS3Q969F9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HPS3Q969F9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HPS3Q969F9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HPS3Q969F9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HPS3Q969F9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HPS3Q969F9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HPS3Q969F9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HPS3Q969F9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HPS3Q969F9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HPS3Q969F9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HPS3Q969F9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HPS3Q969F9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HPS3Q969F9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HPS3Q969F9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HPS3Q969F9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HPS3Q969F9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HPS3Q969F9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HPS3Q969F9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HPS3Q969F9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HPS3Q969F9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HPS3Q969F9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HPS3Q969F9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HPS3Q969F9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HPS3Q969F9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HPS3Q969F9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HPS3Q969F9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HPS3Q969F9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HPS3Q969F9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HPS3Q969F9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HPS3Q969F9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HPS3Q969F9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HPS3Q969F9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HPS3Q969F9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HPS3Q969F9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HPS3Q969F9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HPS3Q969F9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.1 ms