Protein–RNA interactions for Protein: Q92985

IRF7, Interferon regulatory factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF7Q92985 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF7Q92985 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF7Q92985 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF7Q92985 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF7Q92985 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRF7Q92985 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRF7Q92985 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRF7Q92985 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRF7Q92985 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IRF7Q92985 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IRF7Q92985 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IRF7Q92985 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IRF7Q92985 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRF7Q92985 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRF7Q92985 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF7Q92985 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRF7Q92985 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRF7Q92985 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRF7Q92985 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRF7Q92985 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRF7Q92985 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
IRF7Q92985 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF7Q92985 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF7Q92985 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRF7Q92985 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRF7Q92985 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
IRF7Q92985 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRF7Q92985 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRF7Q92985 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRF7Q92985 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRF7Q92985 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRF7Q92985 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRF7Q92985 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRF7Q92985 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRF7Q92985 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRF7Q92985 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRF7Q92985 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRF7Q92985 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
IRF7Q92985 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRF7Q92985 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRF7Q92985 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRF7Q92985 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRF7Q92985 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRF7Q92985 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRF7Q92985 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRF7Q92985 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRF7Q92985 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
IRF7Q92985 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRF7Q92985 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRF7Q92985 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRF7Q92985 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRF7Q92985 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
IRF7Q92985 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRF7Q92985 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRF7Q92985 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
IRF7Q92985 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRF7Q92985 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRF7Q92985 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRF7Q92985 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRF7Q92985 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRF7Q92985 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRF7Q92985 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRF7Q92985 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRF7Q92985 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRF7Q92985 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRF7Q92985 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRF7Q92985 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRF7Q92985 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRF7Q92985 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRF7Q92985 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRF7Q92985 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRF7Q92985 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRF7Q92985 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRF7Q92985 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRF7Q92985 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms