Protein–RNA interactions for Protein: Q92966

SNAPC3, snRNA-activating protein complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC3Q92966 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAPC3Q92966 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAPC3Q92966 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAPC3Q92966 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAPC3Q92966 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAPC3Q92966 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAPC3Q92966 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAPC3Q92966 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAPC3Q92966 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAPC3Q92966 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAPC3Q92966 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAPC3Q92966 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAPC3Q92966 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAPC3Q92966 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAPC3Q92966 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAPC3Q92966 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAPC3Q92966 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAPC3Q92966 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAPC3Q92966 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAPC3Q92966 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAPC3Q92966 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAPC3Q92966 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAPC3Q92966 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAPC3Q92966 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAPC3Q92966 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAPC3Q92966 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAPC3Q92966 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAPC3Q92966 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAPC3Q92966 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAPC3Q92966 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAPC3Q92966 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAPC3Q92966 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAPC3Q92966 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAPC3Q92966 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAPC3Q92966 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAPC3Q92966 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAPC3Q92966 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAPC3Q92966 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAPC3Q92966 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAPC3Q92966 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPC3Q92966 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPC3Q92966 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPC3Q92966 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPC3Q92966 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAPC3Q92966 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAPC3Q92966 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAPC3Q92966 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAPC3Q92966 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAPC3Q92966 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAPC3Q92966 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAPC3Q92966 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAPC3Q92966 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAPC3Q92966 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAPC3Q92966 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAPC3Q92966 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAPC3Q92966 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAPC3Q92966 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAPC3Q92966 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAPC3Q92966 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAPC3Q92966 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAPC3Q92966 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms