Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SMARCC1Q92922 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SMARCC1Q92922 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCC1Q92922 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCC1Q92922 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCC1Q92922 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCC1Q92922 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCC1Q92922 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCC1Q92922 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMARCC1Q92922 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SMARCC1Q92922 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCC1Q92922 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCC1Q92922 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCC1Q92922 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCC1Q92922 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SMARCC1Q92922 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCC1Q92922 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCC1Q92922 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCC1Q92922 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCC1Q92922 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCC1Q92922 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCC1Q92922 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCC1Q92922 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SMARCC1Q92922 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SMARCC1Q92922 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMARCC1Q92922 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCC1Q92922 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCC1Q92922 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCC1Q92922 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMARCC1Q92922 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMARCC1Q92922 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCC1Q92922 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMARCC1Q92922 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCC1Q92922 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCC1Q92922 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCC1Q92922 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCC1Q92922 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCC1Q92922 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCC1Q92922 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCC1Q92922 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCC1Q92922 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCC1Q92922 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCC1Q92922 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SMARCC1Q92922 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SMARCC1Q92922 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SMARCC1Q92922 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCC1Q92922 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCC1Q92922 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCC1Q92922 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SMARCC1Q92922 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCC1Q92922 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SMARCC1Q92922 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SMARCC1Q92922 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.76■■■■□ 3
SMARCC1Q92922 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SMARCC1Q92922 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SMARCC1Q92922 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SMARCC1Q92922 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SMARCC1Q92922 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCC1Q92922 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCC1Q92922 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCC1Q92922 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCC1Q92922 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCC1Q92922 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCC1Q92922 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SMARCC1Q92922 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SMARCC1Q92922 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCC1Q92922 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCC1Q92922 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCC1Q92922 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCC1Q92922 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCC1Q92922 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCC1Q92922 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCC1Q92922 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCC1Q92922 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCC1Q92922 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCC1Q92922 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCC1Q92922 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCC1Q92922 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCC1Q92922 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCC1Q92922 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCC1Q92922 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCC1Q92922 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCC1Q92922 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCC1Q92922 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCC1Q92922 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCC1Q92922 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCC1Q92922 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMARCC1Q92922 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCC1Q92922 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCC1Q92922 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCC1Q92922 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCC1Q92922 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCC1Q92922 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCC1Q92922 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCC1Q92922 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCC1Q92922 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCC1Q92922 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCC1Q92922 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCC1Q92922 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCC1Q92922 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms