Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC4Q92889 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC4Q92889 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC4Q92889 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC4Q92889 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC4Q92889 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC4Q92889 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC4Q92889 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC4Q92889 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC4Q92889 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERCC4Q92889 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERCC4Q92889 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ERCC4Q92889 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ERCC4Q92889 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC4Q92889 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC4Q92889 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC4Q92889 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC4Q92889 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC4Q92889 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC4Q92889 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC4Q92889 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC4Q92889 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC4Q92889 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC4Q92889 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC4Q92889 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC4Q92889 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC4Q92889 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC4Q92889 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC4Q92889 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC4Q92889 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC4Q92889 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC4Q92889 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERCC4Q92889 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERCC4Q92889 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERCC4Q92889 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ERCC4Q92889 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC4Q92889 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC4Q92889 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC4Q92889 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC4Q92889 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC4Q92889 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERCC4Q92889 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERCC4Q92889 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC4Q92889 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC4Q92889 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC4Q92889 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC4Q92889 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC4Q92889 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC4Q92889 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC4Q92889 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC4Q92889 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC4Q92889 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC4Q92889 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC4Q92889 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC4Q92889 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC4Q92889 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC4Q92889 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC4Q92889 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC4Q92889 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC4Q92889 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC4Q92889 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC4Q92889 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ERCC4Q92889 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC4Q92889 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC4Q92889 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC4Q92889 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC4Q92889 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC4Q92889 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC4Q92889 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC4Q92889 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC4Q92889 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC4Q92889 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC4Q92889 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC4Q92889 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ERCC4Q92889 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ERCC4Q92889 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERCC4Q92889 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERCC4Q92889 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERCC4Q92889 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ERCC4Q92889 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ERCC4Q92889 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERCC4Q92889 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC4Q92889 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC4Q92889 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC4Q92889 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC4Q92889 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC4Q92889 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC4Q92889 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC4Q92889 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC4Q92889 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC4Q92889 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC4Q92889 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC4Q92889 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC4Q92889 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC4Q92889 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERCC4Q92889 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERCC4Q92889 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERCC4Q92889 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC4Q92889 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC4Q92889 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms