Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BAP1Q92560 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BAP1Q92560 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BAP1Q92560 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BAP1Q92560 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BAP1Q92560 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BAP1Q92560 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BAP1Q92560 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BAP1Q92560 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BAP1Q92560 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BAP1Q92560 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BAP1Q92560 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BAP1Q92560 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BAP1Q92560 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BAP1Q92560 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
BAP1Q92560 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BAP1Q92560 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BAP1Q92560 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BAP1Q92560 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BAP1Q92560 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BAP1Q92560 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BAP1Q92560 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BAP1Q92560 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BAP1Q92560 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BAP1Q92560 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BAP1Q92560 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BAP1Q92560 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BAP1Q92560 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BAP1Q92560 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BAP1Q92560 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BAP1Q92560 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BAP1Q92560 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BAP1Q92560 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BAP1Q92560 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BAP1Q92560 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BAP1Q92560 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BAP1Q92560 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BAP1Q92560 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BAP1Q92560 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BAP1Q92560 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BAP1Q92560 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BAP1Q92560 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BAP1Q92560 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BAP1Q92560 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BAP1Q92560 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BAP1Q92560 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
BAP1Q92560 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BAP1Q92560 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BAP1Q92560 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BAP1Q92560 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BAP1Q92560 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BAP1Q92560 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BAP1Q92560 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BAP1Q92560 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms