Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CASKIN2Q8WXE0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CASKIN2Q8WXE0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASKIN2Q8WXE0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASKIN2Q8WXE0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CASKIN2Q8WXE0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASKIN2Q8WXE0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASKIN2Q8WXE0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASKIN2Q8WXE0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASKIN2Q8WXE0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASKIN2Q8WXE0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASKIN2Q8WXE0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASKIN2Q8WXE0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASKIN2Q8WXE0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CASKIN2Q8WXE0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASKIN2Q8WXE0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASKIN2Q8WXE0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASKIN2Q8WXE0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASKIN2Q8WXE0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASKIN2Q8WXE0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASKIN2Q8WXE0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASKIN2Q8WXE0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASKIN2Q8WXE0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASKIN2Q8WXE0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CASKIN2Q8WXE0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASKIN2Q8WXE0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASKIN2Q8WXE0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASKIN2Q8WXE0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASKIN2Q8WXE0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASKIN2Q8WXE0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASKIN2Q8WXE0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASKIN2Q8WXE0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASKIN2Q8WXE0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASKIN2Q8WXE0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASKIN2Q8WXE0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASKIN2Q8WXE0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASKIN2Q8WXE0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASKIN2Q8WXE0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASKIN2Q8WXE0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASKIN2Q8WXE0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASKIN2Q8WXE0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASKIN2Q8WXE0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASKIN2Q8WXE0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASKIN2Q8WXE0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CASKIN2Q8WXE0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASKIN2Q8WXE0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASKIN2Q8WXE0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASKIN2Q8WXE0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASKIN2Q8WXE0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASKIN2Q8WXE0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASKIN2Q8WXE0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASKIN2Q8WXE0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CASKIN2Q8WXE0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASKIN2Q8WXE0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASKIN2Q8WXE0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASKIN2Q8WXE0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASKIN2Q8WXE0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASKIN2Q8WXE0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASKIN2Q8WXE0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASKIN2Q8WXE0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASKIN2Q8WXE0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASKIN2Q8WXE0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASKIN2Q8WXE0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASKIN2Q8WXE0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASKIN2Q8WXE0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms