Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY3

PRUNE2, Protein prune homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRUNE2Q8WUY3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRUNE2Q8WUY3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRUNE2Q8WUY3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRUNE2Q8WUY3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRUNE2Q8WUY3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRUNE2Q8WUY3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRUNE2Q8WUY3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PRUNE2Q8WUY3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRUNE2Q8WUY3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PRUNE2Q8WUY3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRUNE2Q8WUY3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PRUNE2Q8WUY3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRUNE2Q8WUY3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRUNE2Q8WUY3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRUNE2Q8WUY3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRUNE2Q8WUY3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRUNE2Q8WUY3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRUNE2Q8WUY3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRUNE2Q8WUY3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRUNE2Q8WUY3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PRUNE2Q8WUY3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRUNE2Q8WUY3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRUNE2Q8WUY3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRUNE2Q8WUY3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRUNE2Q8WUY3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRUNE2Q8WUY3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRUNE2Q8WUY3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRUNE2Q8WUY3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRUNE2Q8WUY3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRUNE2Q8WUY3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRUNE2Q8WUY3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRUNE2Q8WUY3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRUNE2Q8WUY3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRUNE2Q8WUY3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRUNE2Q8WUY3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRUNE2Q8WUY3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRUNE2Q8WUY3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRUNE2Q8WUY3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRUNE2Q8WUY3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRUNE2Q8WUY3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRUNE2Q8WUY3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRUNE2Q8WUY3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRUNE2Q8WUY3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRUNE2Q8WUY3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRUNE2Q8WUY3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRUNE2Q8WUY3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PRUNE2Q8WUY3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRUNE2Q8WUY3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRUNE2Q8WUY3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRUNE2Q8WUY3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRUNE2Q8WUY3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRUNE2Q8WUY3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRUNE2Q8WUY3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRUNE2Q8WUY3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRUNE2Q8WUY3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRUNE2Q8WUY3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRUNE2Q8WUY3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRUNE2Q8WUY3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRUNE2Q8WUY3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRUNE2Q8WUY3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRUNE2Q8WUY3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRUNE2Q8WUY3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRUNE2Q8WUY3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRUNE2Q8WUY3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRUNE2Q8WUY3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRUNE2Q8WUY3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PRUNE2Q8WUY3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRUNE2Q8WUY3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRUNE2Q8WUY3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRUNE2Q8WUY3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRUNE2Q8WUY3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRUNE2Q8WUY3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRUNE2Q8WUY3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRUNE2Q8WUY3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRUNE2Q8WUY3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRUNE2Q8WUY3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRUNE2Q8WUY3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRUNE2Q8WUY3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRUNE2Q8WUY3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PRUNE2Q8WUY3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRUNE2Q8WUY3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRUNE2Q8WUY3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRUNE2Q8WUY3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRUNE2Q8WUY3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRUNE2Q8WUY3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRUNE2Q8WUY3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRUNE2Q8WUY3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRUNE2Q8WUY3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRUNE2Q8WUY3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRUNE2Q8WUY3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRUNE2Q8WUY3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRUNE2Q8WUY3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PRUNE2Q8WUY3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRUNE2Q8WUY3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRUNE2Q8WUY3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRUNE2Q8WUY3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRUNE2Q8WUY3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRUNE2Q8WUY3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRUNE2Q8WUY3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRUNE2Q8WUY3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms