Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTT0

CLEC4C, C-type lectin domain family 4 member C, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4CQ8WTT0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLEC4CQ8WTT0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CLEC4CQ8WTT0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLEC4CQ8WTT0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLEC4CQ8WTT0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLEC4CQ8WTT0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLEC4CQ8WTT0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLEC4CQ8WTT0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLEC4CQ8WTT0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLEC4CQ8WTT0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLEC4CQ8WTT0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLEC4CQ8WTT0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLEC4CQ8WTT0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLEC4CQ8WTT0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLEC4CQ8WTT0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLEC4CQ8WTT0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLEC4CQ8WTT0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLEC4CQ8WTT0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CLEC4CQ8WTT0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLEC4CQ8WTT0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLEC4CQ8WTT0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLEC4CQ8WTT0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLEC4CQ8WTT0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLEC4CQ8WTT0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLEC4CQ8WTT0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLEC4CQ8WTT0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLEC4CQ8WTT0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLEC4CQ8WTT0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLEC4CQ8WTT0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLEC4CQ8WTT0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLEC4CQ8WTT0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLEC4CQ8WTT0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLEC4CQ8WTT0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLEC4CQ8WTT0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLEC4CQ8WTT0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLEC4CQ8WTT0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CLEC4CQ8WTT0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLEC4CQ8WTT0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLEC4CQ8WTT0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLEC4CQ8WTT0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLEC4CQ8WTT0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLEC4CQ8WTT0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLEC4CQ8WTT0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CLEC4CQ8WTT0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLEC4CQ8WTT0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLEC4CQ8WTT0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLEC4CQ8WTT0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CLEC4CQ8WTT0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLEC4CQ8WTT0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLEC4CQ8WTT0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLEC4CQ8WTT0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLEC4CQ8WTT0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLEC4CQ8WTT0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLEC4CQ8WTT0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLEC4CQ8WTT0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLEC4CQ8WTT0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLEC4CQ8WTT0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CLEC4CQ8WTT0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CLEC4CQ8WTT0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLEC4CQ8WTT0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLEC4CQ8WTT0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLEC4CQ8WTT0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLEC4CQ8WTT0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLEC4CQ8WTT0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLEC4CQ8WTT0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLEC4CQ8WTT0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLEC4CQ8WTT0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLEC4CQ8WTT0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLEC4CQ8WTT0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLEC4CQ8WTT0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLEC4CQ8WTT0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLEC4CQ8WTT0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLEC4CQ8WTT0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLEC4CQ8WTT0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLEC4CQ8WTT0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLEC4CQ8WTT0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLEC4CQ8WTT0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLEC4CQ8WTT0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms