Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDD1Q8TEB9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDD1Q8TEB9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDD1Q8TEB9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDD1Q8TEB9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDD1Q8TEB9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDD1Q8TEB9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDD1Q8TEB9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDD1Q8TEB9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDD1Q8TEB9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDD1Q8TEB9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDD1Q8TEB9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDD1Q8TEB9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDD1Q8TEB9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDD1Q8TEB9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDD1Q8TEB9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDD1Q8TEB9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDD1Q8TEB9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDD1Q8TEB9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDD1Q8TEB9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDD1Q8TEB9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDD1Q8TEB9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHBDD1Q8TEB9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHBDD1Q8TEB9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHBDD1Q8TEB9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHBDD1Q8TEB9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHBDD1Q8TEB9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHBDD1Q8TEB9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHBDD1Q8TEB9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHBDD1Q8TEB9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHBDD1Q8TEB9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHBDD1Q8TEB9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHBDD1Q8TEB9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDD1Q8TEB9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDD1Q8TEB9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHBDD1Q8TEB9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHBDD1Q8TEB9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHBDD1Q8TEB9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHBDD1Q8TEB9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHBDD1Q8TEB9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RHBDD1Q8TEB9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RHBDD1Q8TEB9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHBDD1Q8TEB9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHBDD1Q8TEB9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHBDD1Q8TEB9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RHBDD1Q8TEB9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDD1Q8TEB9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDD1Q8TEB9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDD1Q8TEB9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDD1Q8TEB9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDD1Q8TEB9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RHBDD1Q8TEB9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDD1Q8TEB9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDD1Q8TEB9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDD1Q8TEB9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDD1Q8TEB9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHBDD1Q8TEB9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHBDD1Q8TEB9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHBDD1Q8TEB9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RHBDD1Q8TEB9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDD1Q8TEB9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDD1Q8TEB9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDD1Q8TEB9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDD1Q8TEB9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDD1Q8TEB9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDD1Q8TEB9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHBDD1Q8TEB9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHBDD1Q8TEB9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHBDD1Q8TEB9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RHBDD1Q8TEB9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHBDD1Q8TEB9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHBDD1Q8TEB9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RHBDD1Q8TEB9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHBDD1Q8TEB9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHBDD1Q8TEB9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHBDD1Q8TEB9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHBDD1Q8TEB9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHBDD1Q8TEB9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDD1Q8TEB9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDD1Q8TEB9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDD1Q8TEB9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDD1Q8TEB9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDD1Q8TEB9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDD1Q8TEB9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHBDD1Q8TEB9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHBDD1Q8TEB9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHBDD1Q8TEB9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHBDD1Q8TEB9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDD1Q8TEB9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDD1Q8TEB9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDD1Q8TEB9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDD1Q8TEB9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDD1Q8TEB9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDD1Q8TEB9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDD1Q8TEB9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDD1Q8TEB9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDD1Q8TEB9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDD1Q8TEB9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDD1Q8TEB9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDD1Q8TEB9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms